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日本公司退税，是指针对日本消费税税种的退税。一般分为两种，一是出口消费税退税，二是境内商品产生交易后的消费税退税。日本税务部门是鼓励企业做出口贸易行为的，因此在出口退税政策下，很多日本公司都会做消费税的退税申报流程。

一、日本出口消费税退税流程

首先，需要满足条件：

1. 公司主动申请为课税事业单位（类似中国一般纳税人）。
2. 公司的消费税纳税计算方法选择原则课税方式。
3. 消费税税务申报时间提前设定。

其次，需要准备材料：

1. 采购货单清单及费用请求单材料。
2. 出口许可证材料（海关部门提供）。
3. 出口货物清单材料。
4. 出口相关费用凭证等（清关公司提供）。

最后，需要向公司管辖区税务机关进行税务申报：

1. 消费税退税申报相关的明细材料。
2. 消费税及地方消费税的申报材料。
3. 课税标准额等的明细材料。

二、日本境内消费税退税流程

日本境内消费税退税，类似于中国的增值税的计算方式。当企业的进项消费税大于销项消费税的情况下，可以向日本当地税务机关进行申报，退还进项部分的消费税税金。日本当地税务机关以现金的方式将退税退还给各个公司。

总结一下，日本的消费税无论是出口，还是境内，当产生消费税退税业务时，都需要日本会计事务所或日本税理士事务所的专业人员进行测算后，向相关税务机关进行退税申报。